Bueno pues ya está modificado y funcionando perfectamente.
La verdad es que la modificación aunque es bastante sencilla, me ha costado un buen trabajo, porque las soldaduras no son lo mío como se puede ver en las imágenes.
Los botones B, C, Y, Z actúan como Fire, y he dejado los botones START, A y X libres para el siguiente proyecto, el cual consiste en lo siguiente:
Mapear START al pin 5, y A, X al pin 9, con la idea de hacer un conversor con un DB9 macho para conectar el pad, y 2 DB9 hembras que van al Port2 y Port1.
El Port2 irá plano excepto los pines 5 y 9, los cuales irán mapeados a los pines 1 (UP) , 6 (FIRE), y el pin 8 (GND), que irán al DB9 hembra del Port1 y así podré tener un "segundo botón" y el salto en un botón conectando el conversor.
La ventaja de hacerlo así, es poder hacer la modificación en cualquier joy o pad manteniendo el pinaje anterior, y con el conversor poder conectarlo a cualquier pad modificado.