Hola Carlos, antes de nada agradecerte tu ayuda, he probado los dos programas y me pasa lo siguiente:
Con CartographPC:
Al importar una imagen con tiles me la pone como le parece, no la encaja en el espacio de cada tile.
Al pintar un pixel tarda mas de un segundo desde que pulso el raton a mostrarlo en pantalla, cuando en realidad deberia de ser instantaneo (tengo un triple nucleo con 4 gigas de ram) por lo tanto no es nada comodo trabajar con el programa, al menos hasta que se actualice y se arreglen los bugs.
Luego con el Cuneiform, este programa solo es para pintar los tiles, no sirve para mapear, o al menos yo no encuentro la opcion para ello, por mas que busco. Tampoco se pueden mezclar tiles de alta con los que baja, en fin.
Bueno, pues eso, que seguire con TILED hasta que salga otro que funcione mejor.
Un saludo.
Toni.